Tradycją na Jasnej Górze jest udostępnianie w dniu Wszystkich Świętych do zwiedzania XVII-wiecznej krypty z 36 grobami, w których pochowani są paulini. Znajdującą się w Kaplicy Matki Bożej kryptę można odwiedzać do końca listopada.
 
– Pochodząca z XVII w. krypta kryje doczesne szczątki m. in.: o. Piotra Markiewicza, przeora Jasnej Góry w czasie I wojny światowej i długoletniego Generała Zakonu oraz o. Piusa Przeździeckiego, Generała Zakonu Paulinów w okresie II wojny światowej. Od lat 60-tych XX wieku miejscem pochówku zmarłych zakonników stał się cmentarz św. Rocha. Są tam dwa grobowce paulińskie – „starszy”, tuż obok kościoła św. Rocha i „nowszy”, z 1990 r. na tzw. nowej części cmentarza – informuje  o. Stanisław Tomoń, rzecznik Jasnej Góry.

Jak przypomina o. Tomom, w  Kaplicy Matki Bożej znajduje się również kilka XVII-wiecznych nagrobków, które kryją szczątki dobrodziejów sanktuarium, m.in. Heleny z książąt Wiśniowieckich Warszyckiej – kasztelanowej krakowskiej, Stanisława Warszyckiego – wojewody mazowieckiego i kasztelana krakowskiego; księdza Stanisława Krajewskiego, kustosza katedry łowickiej; Jana Klemensa Branickiego – podkomorzego krakowskiego, starosty bocheńskiego i wielickiego. W zaszklonej niszy lewej ściany Kaplicy Matki Bożej umieszczona jest urna z prochami o. Augustyna Kordeckiego.

Z kolei do  bazyliki jasnogórskiej przylegają dwie prywatne kaplice grobowe: Denhoffów i Jabłonowskich.

– Kaplica Aniołów Stróżów została przebudowana w latach 1751-54 r. na mauzoleum grobowe Stanisława Jabłonowskiego, wojewody rawskiego – mówi pulin. – Natomiast Kaplica św. Pawła I Pustelnika to mauzoleum grobowe rodziny Denhoffów. W krypcie pod kaplicą znajduje się około 20 trumien z wieku XVII i XVIII z prochami członków rodziny Denhoffów. Tam także spoczywają też prochy kilku mnichów paulińskich. W ostatnich miesiącach zakończyła się renowacja obu kaplic w ramach Regionalnego Programu Operacyjnego Województwa Śląskiego.

Natomiast przy bazylice jasnogórskiej znajdziemy osobliwą kaplicę Świętych Relikwii.
– W szklanych gablotach pokrywających powierzchnie wszystkich ścian znajdują się relikwiarze świętych i błogosławionych, m.in. św. Honorata, Kandyda, Filipa Nereusza, Donata, Euzebiusza i Walentego, patrona zakochanych. W tej chwili w Kaplicy św. Relikwii trwają prace renowacyjne – informuje o. Tomoń.